Sebastian Schütze hat seit 2009 einen Lehrstuhl für Neuere Kunstgeschichte an der Universität Wien inne. Davor war er wissenschaftlicher Assistent an der Bibliotheca Hertziana (Max-Planck-Institut für Kunstgeschichte) in Rom. In den Jahren 2003-2009 lehrte er als Bader Chair in Southern Baroque Art an der Queen's University in Kingston.