Manfred Zeller studierte Neuere und Neueste Geschichte und Politikwissenschaft an der Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg ), der Russischen Staatlichen Universität für Geisteswissenschaften (RGGU) in Moskau und – mit Russistik als weiterem Fach – der Humboldt-Universität zu Berlin. Seit April 2014 ist er Wissenschaftlicher Mitarbeiter (Forschung, Management) an der Forschungsstelle Osteuropa in Bremen.